Les grandes campagnes océanographiques comme Tara Océans ont popularisé le concept de microbiome marin. Ce dernier est constitué de microorganismes très diversifiés (bactéries, phytoplancton, protozoaires, virus…). Son étude se situe au carrefour d’importants enjeux écologiques comme socio-économiques. Les laboratoires de recherche sur le milieu marin disposent aujourd’hui de techniques de plus en plus puissantes pour collecter, caractériser et expérimenter sur ces populations microbiennes. Ainsi, l’étude du fonctionnement des biofilms et des holobiontes marins, ou celle du rôle des microorganismes en écotoxicologie marine sont des thématiques de recherche en plein essor.

Au cours de cette école d’été, nous proposons aux étudiants une approche concrète de ce domaine, basée sur des formations pratiques aux outils nécessaires et sur des mini-projets expérimentaux. Les participants pourront ainsi acquérir des connaissances et compétences de base pour l’étude de la composition et du rôle des communautés microbiennes marines. Un total de 4 projets différents sont proposés aux étudiants : projet d’étude de la neige marine, de la diversité du plancton marin, de l’importance des biofilms marins, et un projet en écotoxicologie microbienne. Ces ateliers permettront à tous d’acquérir des compétences sur la conception et la mise en œuvre de protocoles expérimentaux en microbiologie marine.

Stage du 1er au 12 juillet 2024 - Inscriptions du 11 au 25 mars 2024.

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Profil des candidats

Étudiants en Master 1 et 2. Ouvert éventuellement aux étudiants en Licence 3 (sous réserve de la validation du diplôme en juin).

Crédits ECTS : 3

Contact

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Équipe pédagogique

Raphaël Lami (MCF SU), François Lantoine (MCF SU), Fabien Joux (MCF SU), Stéphane Blain (PR SU), Laurence Besseau (MCF SU).

Avec le soutien des plateformes technologiques de l’Observatoire, Bio2mar (culture microbienne et biologie moléculaire) et BioPIC (Imagerie-Cytométrie), et du Service des Moyens à la mer.

Observatoire Océanologique
de Banyuls-sur-Mer
1 avenue Pierre Fabre
66650 Banyuls-sur-Mer
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