Au niveau national, le BOSS fait partie du réseau SOMLIT (Service d'Observation en Milieu Littoral), créé en 1995 et labellisé SNO (Service National d'Observation) par l'INSU depuis 1997 pour assurer une description de base des caractéristiques environnementales de l'environnement côtier français. Le réseau regroupe actuellement 10 stations marines réparties sur tout le littoral français.

Ceci implique des mesures d’un ensemble de 15 paramètres biogéochimiques et physiques à un rythme hebdomadaire, où l'analyse est faite selon des politiques et des protocoles, sous le contrôle d’une démarche qualité, bien établie, régulièrement vérifiée et comparée entre les laboratoires participants. C’est ainsi que des exercices d’intercomparaison auxquels participent toutes les stations SOMLIT sont réalisés annuellement. Le but est de s’assurer de la reproductibilité des résultats d’analyse pour chacun des paramètres.